Dix ans se sont écoulés depuis que le fils d’Elena, alors âgé de 6 ans, a disparu sur une plage des Landes. Aujourd’hui, Elena y vit et travaille dans un restaurant de bord de mer. Jusqu’au jour où elle rencontre un adolescent qui lui rappelle son fils.
Première femme océanographe française à pénétrer le monde fermé des marins, Anita Conti embarque en 1952 sur un chalutier. Partant de ses photos, de ses journaux de bord et d'archives audio de sa voix, le film dessine le portrait de cette femme.
Dans une petite ville au bord de l’océan, un groupe d’adolescentes décident de tomber enceintes en même temps. Les adultes n’y comprennent rien, pas plus que les garçons. Pourquoi ces filles, toutes scolarisées dans le même lycée, ont-elles décidé de faire un enfant ?
Sur l’île d’Amami, les habitants vivent en harmonie avec la nature, ils pensent qu’un dieu habite chaque arbre, chaque pierre et chaque plante. Un soir d'été, Kaito découvre le corps d’un homme flottant dans la mer, sa jeune amie Kyoko va l’aider à percer ce mystère. Ensemble, ils apprennent à devenir adultes et découvrent les cycles de la vie, de la mort et de l’amour...