Pendant la seconde guerre mondiale, plusieurs sous-marins allemands, dont le U-96, quitte La Rochelle pour une mission qui va se transformer en cauchemar.
Olga est une aristocrate russe émigrée en France. Quand la guerre éclate, elle rejoint la Résistance. Jules, bon père de famille français choisit de collaborer. Helmut, fils de la noblesse allemande, devient officier SS dans un camp de concentration. Trois destins croisés, trois âmes qui devront répondre de leurs actes devant Dieu pour entrer ou non dans son Paradis...
1942. Evadé du Ghetto de Varsovie, un jeune garçon juif polonais se cache dans la forêt, trouve un refuge puis doit bientôt fuir de ferme en ferme. Pour survivre, il en oublie son nom, cachant qu’il est juif... Adaptant le best-seller de Uri Orlev, d'après une histoire vraie, le cinéaste a voulu créer un film sur la Shoah que, à l'égal des adultes, les enfants aussi pourraient voir.
Mai 1943, Wilhelm et ses hommes sont pris au piège en Russie. Les premiers Juifs sont envoyés dans les camps de la mort et le doute sur la victoire finale s’installe jusqu’à Berlin. Greta, désormais chanteuse, se voit proposer une tournée pour soutenir les troupes. Viktor, lui, rencontre Alina et tous deux se font embrigader par les partisans.