Michel Gondry s'entretient avec Noam Chomsky et illustre les théories du philosophe mais aussi ses confidences personnelles. L'imagination du cinéaste et les techniques les plus simples de l'animation au service de la rigueur intellectuelle du maître.
Ernö Fisch est né en 1903 à Sighet, dans la même petite ville de Transylvanie que son compatriote Elie Wiesel. Ernö Fisch était le seul juif dans sa ville qui a fui la déportation en se cachant dans la forêt et a ainsi survécu à l'Holocauste.
Berlin, Seconde Guerre mondiale. Inquiète quant au sort réservé à ses parents mais surtout déterminée à sauver sa propre vie, Stella, Juive allemande, accepte de collaborer avec la Gestapo. Elle se met alors à dénoncer systématiquement d'autres Juifs.
Depuis la Transylvanie, par Auschwitz et Birkenau jusqu'à Buchenwald, le film accompagne Elie Weisel tout au long du chemin qu'adolescent il a été forcé de parcourir cinquante ans plus tot.
Archives, images en couleurs des camps à l'abandon, texte volontairement froid et accablant... Alain Resnais filme les camps moins de 10 ans après le massacre et demande au rescapé Jean Cayrol d'en écrire le commentaire.
1940. Dans la maison de ses parents réquisitionnée par la Wehrmacht, Charles se lie d'amitié avec le soldat Karl, qui va partir mourir sur le front russe.
1961. La philosophe juive allemande Hannah Arendt est envoyée à Jérusalem par le New Yorker pour couvrir le procès d’Adolf Eichmann, responsable de la déportation de millions de juifs. Les articles qu’elle publie et sa théorie de "La banalité du mal" déclenchent une controverse sans précédent.
Octobre 1944, Auschwitz-Birkenau. Membre du Sonderkommando, ce groupe de prisonniers juifs forcé d’assister les nazis dans leur plan d’extermination, Saul travaille dans l’un des crématoriums quand il découvre le cadavre d’un garçon.