Napoleon Dynamite est un nerd de premier ordre. Associal, désagréable et menteur, il entraîne (malgré lui) dans ses aventures l'oncle Rico, son frère Kip, son ami mexicain Pedro, et la timide et touchante Deb, secrètement amoureuse de lui...
Portia Nathan, la responsable des admissions d'une université, entame une relation amoureuse avec le tuteur de l'un de ses candidats et risque de compromettre sa carrière.