Alors qu’ils font paître leur troupeau dans la montagne, deux adolescents sont attaqués. Nizar, 16 ans, est tué tandis qu’Achraf, 14 ans, doit rapporter un message à sa famille. D'après une histoire vraie.
À travers l’histoire d’un naufragé sur une île déserte tropicale peuplée de tortues, de crabes et d’oiseaux, La Tortue rouge raconte les grandes étapes de la vie d’un être humain. .
A Madagascar, durant les années 1970, les choses évoluent très vite avec la fin du colonialisme. Seules quelques familles vivent encore à Ivato, une des dernières bases militaires françaises à l'étranger. Parmi elles, Thomas, 10 ans, découvre le monde...