À 17 ans, Rudi retrouve sa famille, après une enfance passée dans une institution. Il espère nouer des liens solides et retrouver l'identité de son père, mais il se rend compte qu'il n'est pas le bienvenu. En même temps, il participe à un casting. Fasciné par sa beauté et son innocence, le réalisateur du film recrute Rudi, avant que celui-ci ne commette un meurtre qui va sceller leur destin...
Antoine, jeune banlieusard parisien, suit des études de comptabilité sans grande conviction, partageant son temps entre le rap qu’il pratique avec talent et son job de livreur de sushis. Il croise un jour la route d'une professeur de chant...
Entre journal intime et drame baroque, "Leçons de ténèbres" reconstitue par fragments un voyage fatal placé sous le signe du Caravage. Utrecht, Naples, Rome... trois villes et deux histoires d'amour guident l'itinéraire nocturne d'un homosexuel à la recherche de la beauté perdue.
Yolanda Bell, jeune chanteuse de boléro, se réfugie dans le couvent des rédemptrices humiliées après la mort de son ami Jorge par overdose d'héroïne. Elle est accueillie avec joie et la mère supérieure lui avoue son admiration pour son art.