Un lycéen rencontre son sosie venu d'un monde parallèle qui souhaite éliminer la meilleure amie de celui-ci, copie conforme d'une princesse malfaisante...
Deux ans après les évènements de la 4e grande guerre ninja, Naruto et ses amis sont confrontés au redoutable Toneri Otsutsuki, un descendant de Hamura.