L'Enterprise escorte un négociateur klingon, chargé de signer une paix historique avec la Fédération. Mais le représentant est assassiné. Kirk est accusé.
Sous le commandement du capitaine Kirk, l'équipage de l'Enterprise s'emploie à ressusciter le Vulcanien Spock, qui s'est sacrifié pour sauver ses compagnons.
Au XXIIIe siècle, l'équipage de l'Enterprise et le capitaine Kirk découvrent un engin qui détruit tout sur son passage et menace également d'anéantir la Terre.
