Dean Cage est un ancien soldat, en plein traumatisme après l'assassinat de son meilleur ami. Un soir alors qu'il attend sa fiancée Amy au restaurant, il est soudainement kidnappé par des membres de la CIA.

Cent ans après la disparition du capitaine Kirk, le nouveau vaisseau Enterprise, commandé par Jean-Luc Picard, retrouve sa trace dans le Nexus.