Une jeune femme se réveille, amnésique, sur le sol d'un manoir complètement désert. Elle apprend qu'un virus expérimental, testé au sous-sol, vient de faire des ravages. Exposés à son contact, les scientifiques sont transformés en zombies...
Les ravages liés au virus conçu par Umbrella Corporation se multiplient sur la planète. Les hommes et les femmes sont devenus des morts-vivants cannibales. Une survivante, Alice, mène la résistance. Une course contre la montre est lancée...
Alice est parvenue à sortir vivante du complexe top-secret d'Umbrella Corporation, mais il semble que le virus mortel se soit répandu toute la ville. Tentant de retrouver la fille d'un docteur, elle doit arpenter des rues infestées de monstres...
Les zombies peuplent désormais la Terre et Alice erre sans but sur les routes du Nevada. Aidant un petit groupe de survivants, elle se rapproche, sans le savoir, du laboratoire d'Albert Wesker, qui continue ses terribles expériences génétiques...
Après la bataille de Washington, Alice est la seule survivante. Alors qu'elle a perdu ses pouvoirs, elle veut aider ce qu'il reste de l'humanité, menacée par les hordes de zombies. Elle décide de retourner à Raccoon City, là où tout a commencé...
Alors que le monde est ravagé par un virus, Alice continue son combat contre Umbrella Corporation et, avec l'aide de Claire Redfield, part à la recherche des rares survivants : elles arrivent à Los Angeles, mais la ville est infestée de zombies...