Au XXIe siècle, le réseau Internet couvre le monde entier. Le major Kusanagi, cyberpolicière, dirige une unité secrète spécialisée aux moyens illimités. Elle est sur les traces du Puppet Master, un hacker mystérieux et puissant...
Le soir du Nouvel An 1999, deux lycéens décident de s'incruster dans la dernière grande fête avant le nouveau millénaire. A minuit, la nuit devient plus folle qu'ils n'auraient jamais pu l'imaginer.