Bienvenue sur une autre planète, au milieu d'une vallée perdue à 4000 mètres d'altitude, la plus élevée qui soit habitée dans l'Himalaya. Au milieu d'un paysage minéral et désolé, d'une beauté à couper le souffle, nous suivons l'itinéraire exceptionnel d'un enfant moine.
Namir part en Egypte, son pays d’origine, faire un film sur les apparitions de la Vierge au sein de la communauté copte chrétienne. Très vite l’enquête sert de prétexte pour impliquer tout le village dans une rocambolesque mise en scène…
Solmaz, désespérée accouche d’une fille alors que la famille espérait un garçon. Trois femmes en liberté provisoire fuient la police. Arezou cherche à regagner son village mais craint d’en être rejetée. Nargess, contrôlée par la police, ne peut plus partir. Cherchant son amie, elle frappe à la porte de la maison de la troisième codétenue, Pari. Mais celle-ci doit fuir le foyer : elle est enceinte.
Les apparitions magiques de sa femme défunte et de son fils disparu depuis des années confirment à Oncle Boonmee que sa fin est proche. Dans son domaine apicole, entouré des siens, il se souvient alors de ses vies antérieures...