Adam, 14 ans, partage ses journées dans son petit village tzigane entre la boxe et son ami Julka. Après la mort violente de son père, son monde s'écroule. Sa mère se remarie, et il doit faire face à son beau-père qui lui demande une obéissance sans faille...
En 1992, lors d'un été suffocant et alors que la Tchécoslovaquie est en pleine déliquescence, un jeune détective, Richard Krauz, est en charge d’une nouvelle enquête : le cadavre du sacristain Klokner, a été retrouvé au cimetière, déterré, un clou enfoncé dans la tête. Krauz découvre, derrière cette mise en scène macabre, l’ancienne police secrète qui possédait un dossier “disparu” sur l'Église...
Mars 1968. A la veille du Printemps de Prague, Tomas décroche un emploi à la radio et travaille pour des journalistes qui défient la censure de l'Etat. Soumis à un chantage de la police secrète, il tente de s'en sortir sans trahir ses idéaux.
En Tchécoslovaquie au début des années 1980, le régime communiste musèle l’Église. Deux jeunes séminaristes devront choisir entre la soumission à la police secrète, ou une fidélité à leurs convictions qui pourrait leur coûter la vie.
À Batislava, en 1983, la nouvelle institutrice de l'école manipule ses élèves et leurs parents en leur demandant divers services. Ceux qui s'y plient voient les résultats de leurs enfants grimper, tandis que les autres deviennent ses souffres-douleurs. Les connexions de l'enseignante avec le Parti Communiste font douter les parents : faut-il accepter la situation ou défendre leurs enfants ?
En Bohême, au XIIIème siècle. Christianisme et paganisme s’affrontent. Des brigands, mené par Mikolas, aux ordres du Seigneur Bouc, attaquent une caravane de chevaliers allemands qu’ils tuent sans pitié. C’est le début d’un affrontement violent avec Lazar, allié des allemands, seigneur voisin et voleur, qui destine sa fille, la belle Marketa, au service de Dieu.