Suite à la disparition inquiétante de sa mère, June cherche à la retrouver en utilisant ingénieusement les dernières technologies qu'elle a à portée de main. Mais ses recherches numériques vont la mener à des découvertes inattendues.
Ethan Hunt et l'équipe de l'IMF doivent retrouver l'Entité, une redoutable intelligence artificielle qui menace de lancer une attaque nucléaire après avoir pris le contrôle des systèmes informatiques des plus puissantes armées du monde...