Une jeune femme se réveille, amnésique, sur le sol d'un manoir complètement désert. Elle apprend qu'un virus expérimental, testé au sous-sol, vient de faire des ravages. Exposés à son contact, les scientifiques sont transformés en zombies...
Au XXIIIe siècle, les habitants de la planète du Mal, s'emparent de pierres précieuses symbolisant les 4 éléments, et foncent vers la Terre. Le 5e élément, dissimulé dans Leeloo, une mutante qui atterrit dans le taxi volant de Korben Dallas.
Alice est parvenue à sortir vivante du complexe top-secret d'Umbrella Corporation, mais il semble que le virus mortel se soit répandu toute la ville. Tentant de retrouver la fille d'un docteur, elle doit arpenter des rues infestées de monstres...