Les champions – désormais secondés par Johnny Cage en personne – s’affrontent dans un tournoi ultime, sans foi ni loi, pour tenter de renverser le règne de Shao Kahn, un tyran qui menace l’existence même de l’Earthrealm et de ses partisans.
Alors que le jeune Dee Renjie arrive à la capitale impériale pour devenir officier de la loi, l'impératrice Wu charge le détective Yuchi d'enquêter sur l'attaque de sa flotte navale soi-disant causée par une mystérieuse créature marine...