Dans la famille Furlong, l’aîné de chaque génération est doté d'un pouvoir. James découvre la nature du sien lors d'un accident qui cause la mort de sa famille. Hanté par ce mal mystérieux, il se retire au plus profond de la forêt pour ne plus nuire à ses proches. Quelques années plus tard, une adolescente en révolte et atteinte d’un mal incurable, rencontre James dans la forêt.
En 1954, l'officier Teddy Daniels et son coéquipier Chuck Aule sont envoyés enquêter sur l'île de Shutter Island, dans un hôpital psychiatrique où sont internés de dangereux criminels. L'une des patientes, Rachel Solando, a inexplicablement disparu...