Jane Morton est psychiatre et décide de partir étudier le cas de Dorothy, une adolescente accusée de tentative de meurtre qui vit sur une île au nord de l'Irlande. Quand Jane arrive, elle découvre une communauté recluse où secrets et phénomènes étranges se mélangent.
Dublin, années 60. Trois jeunes filles arrivent ensemble au couvent des soeurs Madeleine : Margaret, qui a été violée par son cousin, Bernadette, l'orpheline délurée, et Rose, toute nouvelle fille-mère ayant dû abandonner son bébé dans une famille catholique. La redoutable Supérieure, soeur Bridget, leur demande de se racheter par le travail et la prière pour échapper à la damnation éternelle.