Zatoïchi tente de se retirer dans son village natal, mais la violence le rattrape lorsqu'il se retrouve mêlé à un conflit entre un clan de yakuzas et des villageois opprimés.
Joseph, l'un des derniers bergers du littoral corse, refuse de céder son terrain, convoité par le milieu pour un projet immobilier. Quand il tue accidentellement l'homme venu l'intimider, il se retrouve forcé de prendre la fuite...