Depuis la propagation d’un étrange et foudroyant virus, le monde est devenu terrifiant : sortir est désormais impossible. À Barcelone, Marc, piégé dans son bureau avec son pire ennemi, se retrouve séparé de sa femme Julia...
Obsédé par le film "The Human Centipede" et par le projet du Docteur Heiter, Martin, un gardien de nuit pervers et sadique, kidnappe douze personnes pour créer son propre mille-pattes humain, et le tube digestif le plus long du monde.