Lord Rayden, Dieu du Tonnerre et des Eclairs, fait équipe avec un guerrier, un maître en arts martiaux et une jeune détective pour remporter le tournoi Mortal Kombat. S'ils échouent, ce sera la fin de l'Humanité.
A peine revenus sur la Terre, victorieux du Mortal Kombat, les guerriers réunis par Raiden, Dieu du tonnerre et des éclairs, déchantent: le ciel se déchire et de sombres créatures en descendent. A leur tête, l'empereur d'Outremonde, Shao-Kahn lui-même.
Lorsque les plus grands champions de la Terre sont appelés à combattre les ennemis de l'Autre Monde, ils doivent découvrir leurs véritables pouvoirs pour sauver notre planète de l'annihilation totale.