Octobre 1944, Auschwitz-Birkenau. Membre du Sonderkommando, ce groupe de prisonniers juifs forcé d’assister les nazis dans leur plan d’extermination, Saul travaille dans l’un des crématoriums quand il découvre le cadavre d’un garçon.
Archives, images en couleurs des camps à l'abandon, texte volontairement froid et accablant... Alain Resnais filme les camps moins de 10 ans après le massacre et demande au rescapé Jean Cayrol d'en écrire le commentaire.
1940. Dans la maison de ses parents réquisitionnée par la Wehrmacht, Charles se lie d'amitié avec le soldat Karl, qui va partir mourir sur le front russe.