Menacés par l'arrivée d'une comète qui fonce droit sur la planète Terre, Gokû et ses amis font face à Slug, un Namek qui convoite les boules de cristal pour obtenir la jeunesse éternelle.
Bob Harris, acteur sur le déclin, va à Tokyo pour tourner un spot publicitaire. Perdu dans la ville, il rencontre Charlotte, une jeune Américaine, délaissée par son mari, qui loge dans le même hôtel.
Ichiko est infirmière à domicile. Elle travaille au sein d'une famille qui la considère depuis toujours comme un membre à part entière. Mais lorsque la cadette de la famille disparaît, Ichiko se retrouve suspectée de complicité d'enlèvement.
Etsuko est inquiète. Son mari, ses collègues, ses amis semblent différents, comme si ils avaient perdus toute émotion. Pour sauver les gens qu'elle aime, Etsuko va devoir faire face à un envahisseur, volant les émotions des humains.
Au XXIe siècle, le réseau Internet couvre le monde entier. Le major Kusanagi, cyberpolicière, dirige une unité secrète spécialisée aux moyens illimités. Elle est sur les traces du Puppet Master, un hacker mystérieux et puissant...