Vingt-cinq ans après l’effondrement environnemental de la Terre, la Mère, le Père et le Fils, confinés dans un somptueux bunker, préservent un semblant de normalité. Mais, lorsqu’une Fille se présente à leur porte, leur optimisme commence à s’effriter.
En quête de ses racines, Sachiko rend visite à sa famille japonaise installée à Sumatra. Tout le monde ici essaie de se reconstruire après le tsunami qui a ravagé l’île il y a dix ans. À son arrivée, elle apprend qu'un homme a été retrouvé sur la plage...
Pennsylvanie. Après la mort de son épouse, Graham Hess a renoncé à sa charge de pasteur et souhaite désormais assurer au mieux l'éducation de ses enfants. Mais un jour, il découvre d'étranges structures, dessinées au beau milieu de ses champs.