Le capitaine Richard Phillips et son équipage sont pris en otage sur le Maersk Alabama par des pirates somaliens, alors qu’ils acheminent de l'aide humanitaire vers la Corne de l'Afrique. N'arrivant pas à prendre le contrôle du navire, les pirates, menés par un certain Muse, enlèvent le capitaine...
Peter Pan, à présent adulte, est devenu avocat d'affaires. Il s'est marié et a eu deux enfants, qu'il néglige un peu. À l'occasion de Noël, il se retrouve avec sa famille chez Wendy, devenue grand-mère. La nuit même, le capitaine Crochet enlève ses enfants…