Les Yanomami, tribu indigène de l'Amazonie brésilienne, mènent une lutte acharnée pour préserver leur territoire et leur mode de vie ancestral. Davi Kopenawa, chaman et porte-parole de sa communauté, lance un appel urgent à la sauvegarde de la forêt...
Sheeta, jeune adolescente poursuivie par des militaires qui convoitent la pierre magique qu'elle possède, rencontre Pazu, un jeune mécanicien rêvant de devenir pilote. Ensemble, ils décident de se lancer à la recherche d'une légendaire cité volante.
Dans un futur proche et incertain, un brusque changement climatique du aux expériences de l'Homme sur la nature, a mené la vie sur Terre au bord de son extinction. Le professeur Erol Erin, qui travaille pour une importante firme agronomique, part à la recherche de Cemil Akman, un scientifique contraint à l'exil à cause de ses recherches.