Un chef de la pègre de Hong Kong fait assassiner le responsable de la brigade des stupéfiants et fait porter le chapeau au brave Brandon. Ce dernier est incarcéré pour huit longues années. A sa sortie, il décide de se venger...
La jeune peintre Dezzy se retrouve en panne d'inspiration au moment où elle espérait apposer la dernière touche à ce qu'elle voit comme son chef-d'oeuvre. Pour tenter de retrouver sa créativité, elle plonge dans l'alcool et la drogue et multiplie les virées nocturnes dans les bas-fonds de Los Angeles...
Oscar et sa sœur Linda habitent Tokyo. Oscar survit de petits deals de drogue, Linda est stripteaseuse dans une boite de nuit. Un soir, lors d'une descente de police, Oscar est touché par une balle. Tandis qu'il agonise, son esprit, fidèle à la promesse faite à sa sœur de ne jamais l'abandonner, refuse de quitter le monde des vivants...
Les Machines préparent leur assaut contre Zion, dernier bastion de l'humanité. À l'intérieur de la forteresse, la résistance s'organise, mobilisant tout le monde. Pendant ce temps, dans le monde virtuel, l'agent Smith s'attaque à l'Oracle...
Bill Lee, ex-junkie, recyclé dans l'extermination des cafards, tue sa femme accidentellement après l'avoir surprise faisant l'amour avec leurs deux meilleurs amis.