À Tokyo, le jeune Ren fugue dans les rues de Shibuya. Son chemin croise celui de Kumatetsu, une bête issue du royaume des monstres, et qui prétend au titre de grand seigneur de son monde. Ce dernier choisit le jeune garçon comme apprenti.
Hushpuppy, 6 ans, vit dans le bayou avec son père. Brusquement, la nature s'emballe, la température monte, les glaciers fondent, libérant une armée d'aurochs. La montée des eaux, l'irruption des aurochs et la santé de son père qui décline, décident Hushpuppy à partir à la recherche de sa mère disparue.