En 1919, un juge est chargé de statuer sur le sort d'un héros de guerre, revenu très marqué des tranchées et soutenu par un chien qui le suit partout.
Alors qu’ils font paître leur troupeau dans la montagne, deux adolescents sont attaqués. Nizar, 16 ans, est tué tandis qu’Achraf, 14 ans, doit rapporter un message à sa famille. D'après une histoire vraie.
À travers l’histoire d’un naufragé sur une île déserte tropicale peuplée de tortues, de crabes et d’oiseaux, La Tortue rouge raconte les grandes étapes de la vie d’un être humain. .
A Madagascar, durant les années 1970, les choses évoluent très vite avec la fin du colonialisme. Seules quelques familles vivent encore à Ivato, une des dernières bases militaires françaises à l'étranger. Parmi elles, Thomas, 10 ans, découvre le monde...